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TAPS+测序
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创新TAPS+测序方案:一次测序,同时捕获甲基化与基因变异双组学信息

287 人阅读发布时间:2026-06-10 17:03

在表观遗传研究里,DNA甲基化测序已成为探索基因表达调控、发育过程和疾病机制的关键技术,亦是高分文章的标配技术。同时,DNA甲基化与遗传变异的交互作用已成为病理机制、发育生物学、基础与转化医学的关键研究方向。但随着对DNA完整性、起始量、修饰特异性要求的提升,越来越需要高性能、低投入量和低损伤的甲基化检测技术。

近年来,艾斯基因持续深耕测序技术全链条布局,并于2026年年初重磅上线了新品TAPS+测序,即TET酶辅助吡啶peng烷测序。TAPS+测序仅需构建一个文库,即可在单碱基分辨率上同时分析甲基化、单核苷酸变异(SNV)、插入缺失变异(lnDel)以及拷贝数变异(CNV)等信息,不仅大大降低建库、测序及分析成本,且能完全消除样品因多次建库而造成的批次差异,实现高测序质量、高数据有效率及高位点覆盖能力,支持在发现、转化及人群队列研究中开展多模态分析,并应用于多种癌症的早期检测与监测等临床实践中。

技术原理

TAPS+是一种创新的基于正向读取的甲基化测序化学技术,它基于TET氧化酶联合还原剂吡啶peng烷,通过专有的化学转换技术,仅将甲基化胞嘧啶(5mC)转换为胸腺嘧啶(T),而未甲基化的C不会发生转化,可最大限度地保留原始的A, T, G, C序列多样性,提高读取的数据质量。这种正向转化机制使得基因组原始序列不被破坏,甲基化信号作为第五碱基被直接读取,遗传变异信息(如SNV、InDel、CNV、SV)得以保留,避免了传统BS-Seq的信息丢失、序列扭曲、片段损伤问题。

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图1.相较于传统甲基化测序,TAPS+保留了天然四种碱基的复杂度并直接读取5mC信号

技术优势

01 一次检测,双重捕获
一次建库可同时获得SNV、Indel、CNV、甲基化、片段组学等多模态分析信息。
02 高转化率、高可信度
大于98%的5mC转化率——包括所有高甲基化和低甲基化区域;高可信度的结果——真阳性率高,假阳性率低。
03 更好的文库复杂度和覆盖度
TAPS+提高了序列比对率(Mappability),减少多重比对/低复杂度导致的数据丢失,在同样测序深度下提高CpG位点的覆盖度。
04 样品兼容性广
支持包括FFPE样本及cfDNA的检测分析,起始量更低( 1-200ng DNA),稳定可靠的性能表现,具有更广泛的应用潜力。
05 简便、快捷、易于自动化
整个工作流程可在6小时内完成文库构建,无需使用纯化柱。

性能比较(从单一文库中获得多模态洞察)

 

精准的甲基化谱分析TAPS+通过保留基因组天然的4碱基多样性,改善了序列比对和质控指标。其高效的5mC转化率(>98%)极低的假阳性率(<0.3%)相结合,可在低甲基化和高甲基化区域均实现精准的甲基化谱分析。

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图2. TAPS+与传统甲基化技术的5mC转化率和假阳性率对比

 

精准变异检测TAPS+保留4碱基序列复杂度及天然基因组覆盖特征,能够以与未TAPS+转化对照组相当的精度,精准检测SNV、Indel和CNV。

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图3. TAPS+的SNV和CNV检测性能数据

 

TAPS+cfDNA检测:无损、更灵敏:TAPS+可保留cfDNA片段完整性并实现高CpG位点覆盖度,组织溯源分析结果准确可靠,数据一致性好,从而能够基于低起始量样本开展高分辨率的甲基化与片段组学分析。

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图4. TAPS+保留了cfDNA片段组学特征,且在同等测序深度下实现更高的CpG位点覆盖

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图5. TAPS+ cfDNA甲基化组织溯源性分析结果准确可靠,数据在不同起始量组间具有高度一致性。

 

FFPE检测:更好的数据质量与覆盖度:TAPS+能够保留FFPE困难样本中的DNA完整性,支持从单一文库中同步检测甲基化与基因组变异。其温和的化学处理方式可提高CpG位点覆盖度,减少假阳性结果(包括甲转和变异检测假阳性),从而提升肿瘤相关研究的样品包容性和分析准确性。

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TAPS+作为新一代无亚硫酸盐甲基化测序技术,拓展了DNA甲基化检测的边界,它直接对发生甲基化的碱基进行转化,既守住了单碱基分辨率的核心需求,又完整保留了基因组的原始信息这为疾病早期筛查、分子分型等需要整合多组学信息的前沿领域,提供了一个“精准、高效、低损、经济”的强大工具解决方

艾斯基因已在实际项目样本中展现了其在数据利用率、甲基化检测精度可靠性等多个维度上的优势。如需了解整体解决方案、开展项目合作,欢迎联系艾斯基因。

TAPS+技术应用场景

  • 肿瘤早筛早诊、治疗反应评估、微小残留病监测(MRD),尤其是多模态分析可提高检测灵敏度及特异性,提示肿瘤发生发展机制,发掘潜在标志物;

  • 基础和转化研究:肿瘤学,发育生物学,衰老,神经生物学;

  • 遗传病筛查:检测基因突变与甲基化异常,支持早期筛查与风险评估

  • 动植物疾病研究:研究感染中宿主甲基化动态,解析免疫-病原表观调控网络。

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TAPS+技术案例文章

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甲基化检测技术对比

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